De romantische aura en de grandeur van deze tempel van Isis lokte vele pelgrims door de eeuwen heen hier naar toe. In de 19e eeuw was het zelfs de belangrijkste toerist attractie. Nadat de oude Aswan dam werd gebouwd, kwam het complex de helft van het jaar onderwater te staan, zodat de toeristen per boot door het complex heen geleid werden. Echter toen ook de Hoge dam klaar was, dreigde de tempel geheel onder water komen te staan. De Unesco kwam tussenbeide en heeft het complex steen voor steen gesloopt en weer herbouwd op het nabij gelegen eilandje Agilkia en werd zo het heilige Isis eiland. De cultus van Isis op Philae gaat terug naar de 7e eeuw voor Christus, doch de oudste overblijfselen op het eiland dateren van de laatste autochtone koning Nectanebo de 1e (380-362 jaar voor Christus) De belangrijkste ruïne werd gebouwd door Ptolemy de 2e Philadelphus en de jaren er na tot de tijd van keizer Diocletian(284-305 na Christus). Tijdens de Romeinse jaren werd Isis de belangrijkste aanbeden god tot in het Romeinse koninkrijk en zelfs tot aan Brittannië. Vroege Christenen hervormden de hypostijl hal om tot een kapel en ontdeden de tempel van de in hun ogen heidense kenmerken, wat later weer veranderd is door de vroege moslims.